Understanding the genomic makeup of tumors to guide personalized medicine

dc.contributor
Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.contributor.author
Rubio Pérez, Carlota
dc.date.accessioned
2018-12-14T17:16:14Z
dc.date.available
2019-11-28T00:00:13Z
dc.date.issued
2017-11-28
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/10803/664287
dc.description.abstract
Cancer is a disease of the genome. The study of tumor genomic alterations is used to guide several precision medicine strategies, some approved and a large number under clinical development. On the other hand, the study of tumor immunity is recently becoming the key for the success of other personalized strategies, named immunotherapies. Along this thesis I have made several contributions towards the advance of cancer precision medicine, based on the study of tumor “omics” data. First, I evinced the landscape of genomic-guided anti-cancer therapies. Second, I developed OncoPaD, a tool for the rational design of cost-effective cancer gene panels. Third, I contributed to the development of Cancer Genome Interpreter, a tool for the biological and therapeutic interpretation of variants found in newly sequenced tumors. Forth, I identified tumor intrinsic molecular mechanisms involved in tumor immune evasion.
dc.description.abstract
El càncer és una malaltia del genoma. L'estudi de les alteracions genòmiques dels tumors s’utilitza com a guia en varies estratègies de medicina de precisió, algunes d'elles aprovades i d'altres en assajos clínics. D'altra banda, l’estudi de la immunitat tumoral està esdevenint una peça clau per l’èxit d’altres estratègies terapèutiques, anomenades immunoteràpies. Al llarg d'aquesta tesi, mitjançant l'estudi de les dades “òmiques” tumorals, he contribuït de varies maneres cap a l'avenç de la medicina de precisió pel càncer. Primer, he identificat el panorama de les teràpies anticanceroses guiades per alteracions genòmiques. Segon, he desenvolupat OncoPaD, una eina pel disseny cost-efectiu i racional de panells de seqüenciació per càncer. A més, he contribuït al desenvolupament del Cancer Genome Interpreter, una eina que ajuda a la interpretació biològica i terapèutica de les variants presents a tumors novament seqüenciats. Per últim, he identificat diversos mecanismes mitjançant els quals els tumors són capaços d'evadir l’atac del sistema immunològic.
dc.format.extent
355 p.
dc.format.mimetype
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Universitat Pompeu Fabra
dc.rights.license
ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.source
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.subject
Genomics
dc.subject
Cancer
dc.subject
Personalized medicine
dc.subject
Next-generation sequencing
dc.subject
Targeted therapies
dc.subject
Genòmica
dc.subject
Càncer
dc.subject
Medicina personalitzada
dc.subject
Seqûenciació de nova generació
dc.subject
Teràpies dirigides
dc.title
Understanding the genomic makeup of tumors to guide personalized medicine
dc.type
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.subject.udc
575
dc.contributor.authoremail
carlota.rubio@irbbarcelona.org
dc.contributor.director
López Bigas, Núria
dc.contributor.director
González Pérez, Abel
dc.embargo.terms
cap
dc.rights.accessLevel
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.description.degree
Programa de doctorat en Biomedicina


Documents

tcrp.pdf

16.21Mb PDF

Aquest element apareix en la col·lecció o col·leccions següent(s)