Cutibacterium acnes strain improvement and establishment of skin microbiome sequencing technologies

Author

Rozas Belmonte, Miquel

Director

Paetzold, Bernhard

Güell, Marc

Date of defense

2022-10-03

Pages

96 p.



Department/Institute

Universitat Pompeu Fabra. Departament de Medicina i Ciències de la Vida

Doctorate programs

Programa de doctorat en Biomedicina

Abstract

Certain skin disorders are associated with skin microbiome dysbiosis, highlighting the importance of the microbiome in the maintenance of the skin's healthy state. Modulating the microbiome to reestablish its healthy state is a novel strategy to treat such skin diseases. One strategy to modulate the skin microbiome and obtain dermatological benefits is through the topical application of probiotics. Identifying and selecting the most suitable bacterial strains to treat specific skin diseases is key to success. In this research a Cutibacterium acnes strain phenotype was improved using non-GMO techniques, making its usage as a probiotic for more skin diseases possible. Furthermore, taxonomic identification of skin microbiome samples using Nanopore sequencing was benchmarked and improved, contributing to advancements in both diagnosis and novel treatments. Finally, a probiotic cocktail was clinically evaluated on patients suffering from acne vulgaris, showing dermatological benefits as well as skin microbiome modulation effects. In summary, this research contributed to the advancement in treating skin diseases by generating new probiotics, benchmarking and improving bacterial taxonomic identification using Nanopore sequencing and proving the benefits of a bacterial cocktail in treating acne vulgaris.


Ciertas enfermedades de la piel están asociadas a un desbalance en el microbioma de la piel, resaltando la importancia del microbioma en mantener la piel sana. Modular el microbioma para restablecer su estado sano es una estrategia novedosa para tratar esas enfermedades de la piel. Una estrategia para modular el microbioma de la piel y obtener beneficios dermatológicos es la aplicación tópica de probióticos. Identificar y seleccionar las bacterias que más se adecuan para tratar especificas enfermedades de la piel es clave para el éxito en su tratamiento. En esta investigación, el fenotipo de una cepa de Cutibacterium acnes ha sido mejorado sin usar metodologías de transgénicos, habilitando su uso como probiótico en más enfermedades de la piel. Además, hemos evaluado y mejorado la clasificación taxonómica del microbioma de la piel usando Nanopore sequencing, contribuyendo así a avances en el diagnóstico y el desarrollo de nuevas terapias para tratar problemas dermatológicos. Finalmente, un coctel de probióticos fue probado en un estudio clínico en pacientes con acné, demostrando mejoras dermatológicas y su capacidad de modular el microbioma de la piel. En resumen, esta investigación ha contribuido al avance en el tratamiento de enfermedades de la piel generando nuevos probióticos, evaluando y mejorando la clasificación taxonómica del microbioma de la piel usando Nanopore sequencing y demostrando los beneficios del coctel bacteriano para tratar el acné.

Keywords

Skin; Microbiome; Sequencing; Probiotics; Cutibacterium; Pell; Microbioma; Sequenciacio

Subjects

616.5 - Skin. Common integument. Clinical dermatology. Cutaneous complaints

Documents

tmrb.pdf

1.279Mb

 

Rights

ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.

This item appears in the following Collection(s)