Molecular mechanisms of alternative splicing regulation by antitumor drugs targeting U2 snRNP

Author

Vigevani, Luisa

Director

Valcárcel, J. (Juan)

Date of defense

2016-11-21

Pages

187 p.



Department/Institute

Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut

Doctorate programs

Programa de doctorat en Biomedicina

Abstract

RNA splicing is the process of removal of introns from pre-mRNAs. It is carried out by the spliceosome, composed of five small nuclear ribonucleoproteins (snRNPs). Several small molecules with antitumor properties target SF3B1, a U2 snRNP component frequently mutated in cancer that helps U2 snRNP recruitment to branch point (BP) sequences required for splicing catalysis. Together with collaborators from the University of Barcelona, we describe a new drug variant with improved splicing inhibitory and antiproliferative activities, as well as the novel concept of drug-antisense oligonucleotide conjugates. We report that 3' splice site sensitivity to drugs is finely tuned by transcripts’ sequence content. We also show that different drug variants display both similarities and differences in alternative splicing modulation.


ARN splicing consiste en la eliminación de intrones de moléculas de pre-mARN. Es llevado a cabo por el spliceosoma, compuesto por cinco ribonucleoproteínas nucleares pequeñas (snRNPs). Varios compuestos con propiedades antitumorales tienen como diana SF3B1, un componente de U2 snRNP frecuentemente mutado en cáncer que ayuda al reclutamiento de U2 snRNP a secuencias branch point (BP) necesarias para la catálisis. Junto a colaboradores de la Universidad de Barcelona, describimos una nueva variante de estos compuestos con mayor actividad de inhibición de splicing y anti-proliferativa, así como el nuevo concepto de conjugados fármaco-oligonucleótido. Observamos que la sensibilidad de los sitios 3' de splicing a estos compuestos está moduladas por la secuencia de los transcriptos. También mostramos que diferentes variantes de compuestos tienen actividades similares y diferentes en la modulación de distintos eventos de splicing alternativo.

Keywords

Alternative splicing; Antitumor drugs; SF3B1; Spliceosome; U2 snRNP; Splicing alternativo; Fármacos antitumorales

Subjects

577 - Material bases of life. Biochemistry. Molecular biology. Biophysics

Documents

tlv.pdf

7.875Mb

 

Rights

ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.

This item appears in the following Collection(s)