Dynamic Factors of Bacteriorhodopsin: Regulation Key Points in Helices B, C and F

Author

Perálvarez Marín, Alejandro

Director

Querol Murillo, Enrique

Padrós, Esteve

Date of defense

2005-07-07

ISBN

8468965421

Legal Deposit

B-6021-2006



Department/Institute

Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular

Abstract

The main objective of this work is the analysis of the structural and functional role of some amino acids in Bacteriorhodopsin.<br/>- Characterization of the motif Thr90-Pro91 in the centre of Helix C of Bacteriorhodopsin. Because Thr90 interacts with Asp115 through a hydrogen bond and with the retinal through hydrophobic interaction, the mutants T90V and D115A were taken into account. The following objectives were settled:<br/>Design and construct the Bacteriorhodopsin mutants P91A, T90A,T90V and D115A by site directed mutagenesis.<br/>Express the mutants in the purple membrane of Halobacterium salinarum.<br/>Analyze the role of Thr90 and Pro91 in the properties of the protein and in the proton pumping function in particular through the study of the mutants.<br/>Infer a role to the motif Thr90-Pro91 in Bacteriorhodopsin.<br/>- Analyze the role of the other two Prolines located in transmembrane helices in BR, and to extend this role to other Transmembrane Proteins. The subsequent objectives were proposed:<br/>Design and construct the Bacteriorhodopsin mutants P50A and P186A by site directed mutagenesis.<br/>Express the mutants in the purple membrane of Halobacterium salinarum.<br/>Characterize the role of Pro50, and Pro186 in Bacteriorhodopsin properties and proton pumping through the analysis of the mutants.<br/>Infer a role to Helix-embedded prolines of Bacteriorhodopsin in particular and to transmembrane helices of proteins in general.

Keywords

Biofísica; Bacteriodopsina; Proteïnes transmembrana

Subjects

577 - Material bases of life. Biochemistry. Molecular biology. Biophysics

Knowledge Area

Ciències de la Salut

Documents

apm1de1.pdf

6.125Mb

 

Rights

ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.

This item appears in the following Collection(s)