Functional genomics of wound healing in drosophila = Genòmica funcional del procés de cicatrització en drosophila

Author

Tamirlsa, Srlvldya

Director

Martín Blanco, Enrique

Tutor

Serras Rigalt, Florenci

Date of defense

2014-07-14

Legal Deposit

B 21544-2014

Pages

202 p.



Department/Institute

Universitat de Barcelona. Departament de Genètica

Abstract

La ciencia básica ha de engarzarse con las necesidades sociales. Así, nuestro laboratorio esta involucrado en identificar genes específicamente modulados durante el proceso de cicatrización mediante estudios transcriptómicos en colaboración con diversos grupos. En esta línea, en esta Tesis se han perseguido una serie de objetivos concretos: 1) Realización de un análisis funcional de nuevos genes implicados en cicatrización (discos imaginales). 2) Comparación de los genes identificados en cicatrización en Drosophila con genes identificados en modelos de cicatrización en vertebrados. Más en detalle: • Estudio y descripción de la cicatrización en discos imaginales de Drosophila in vitro. • Identificación de genes cuya expresión cambia en las células activas en el proceso de cicatrización. • Caracterización fenotípica de genes que afectan al proceso de cicatrización (definición de categorías fenotípicas) • Caracterización detallada de un subset de genes involucrados en la regulación del proceso de cicatrización • Identificación de reguladores de cicatrización conservados en la filogenia. • Análisis del papel del citoesqueleto de actina en el proceso de cicatrización (el papel del complejo TCP1 (una chaperonina esencial) • Exploración del papel del complejo TCP1 en la regulación del citoesqueleto de actina y tubulina A lo largo de este trabajo hemos alcanzado las siguientes conclusiones: 1. La cicatrización in vitro requiere la actividad de la cascada de señalización de la JNK que controla la formación de contactos transitorios entre los epitelios 2. Han sido identificados una serie de nuevos genes modulados transcripcionalmente durante el proceso de cicatrización. 3. El análisis por interferencia o sobreexpresión de estos genes ha permitido identificar aquellos funcionalmente relevantes en la fusión de los discos imaginales y en la reparación del tejido imaginal. 4. El agrupamiento fenotípico de estos genes ha permitido definir a nivel celular las etapas requeridas para la reparación precisa de los discos imaginales. 5. Las clases principales de genes involucrados en el proceso de cicatrización son las de los reguladores del citoesqueleto de actina y transductores de señales. 6. La caracterización funcional de un subset de genes involucrados en cicatrización analizando marcadores específicos ha permitido definir la red de interacciones entre ellos y su coordinación espaciotemporal. 7. El complejo TCP1 es esencial para la cicatrización de los discos imaginales. 8. La interferencia en la expresión de distintas subunidades del complejo TCP1 demuestra su papel en la fusión de discos imaginales, cicatrización y control del citoesqueleto (actina y tubulina) en Drosophila. 9. Estudios comparativos entre Drosophila y vertebrados a nivel transcriptómico ha permitido identificar una serie de genes conservados entre distintos phila y regulados a nivel transcripcional durante la cicatrización. 10. Análisis funcionales de estos genes demuestran un papel conservado a lo largo de la filogenia apuntando a candidatos potenciales para estudios translacionales.

Keywords

Drosòfila; Drosophila; Genòmica; Genómica; Genomics; Regeneració (Biologia); Regeneración (Biología); Regeneration (Biology); TCP1

Subjects

575 - General genetics. General cytogenetics

Knowledge Area

Ciències Experimentals i Matemàtiques

Note

Tesi realitzada a l'Institut de Biologia Molecular de Barcelona (IBMB - CSIC)

Documents

Srividya_Tamirisa_THESIS.pdf

7.638Mb

 

Rights

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