Cristal•lització de la lipoxigenasa de "Pseudomonas aeruginosa" 42A2 i estudi filogenètic de les subfamílies de les lipoxigenases

Author

Garreta i Gambús, Albert

Director

Manresa Presas, Ma. Ángeles (María Ángeles)

Busquets Abió, Montserrat

Date of defense

2010-06-18

Legal Deposit

B. 4654-2013

Pages

259 p.



Department/Institute

Universitat de Barcelona. Departament de Microbiologia i Parasitologia Sanitàries

Abstract

Les lipoxigenases són conegudes com les responsables de la catàlisi d'oxigenació molecular d’àcids grassos poli-insaturats que forma un producte hydroperoxid (tòxic) que es pot convertir en una gran varietat de metabòlits secundaris. Durant anys, la presència de lipoxgenases ha estat descrita únicament en organismes eucariotes, mamífers, plantes, petits invertebrats marins i fongs. La funció biològica de les lipoxigenases eucariotes ha estat àmpliament estudiada. Estan involucrades en la síntesi de molècules de senyalització com els leucotriens, en mamífers, o en la de l’àcid jasmònic, en plantes. L’any 1964, Shimahara, publicava la presència d’una lipoxigenasa en un bacteri gram-negatiu aïllat de les escombraries. Encara avui són poques les informacions referents a lipoxigenases bacterianes que s'han publicat, alguns exemples són les de Thermoactinomyces vulgaris, Pseudomonas i Nostoc punctiforme. Els anàlisis que s’han realitzat utilitzant el programa BLAST, indiquen que hi ha gens “LOX-like” en Shewanella, Burkolderia, Nitrosomonas i Myxococcus, però la funció biològica de lipoxigenases procariotes encara no s'ha aclarit. No obstant, les lipoxigenases publicades en la base de dades “gene data-bank” són d’organismes ambientals de medi marí i de sòls, això suggereix que les lipoxigenases poden tenir un paper important en la biodegradació. En aquest estudi es reporta la primera estructura molecular d'una lipoxigenasa procariota i un estudi preliminar de la filogènia d’aquest grup de proteïnes.


The lipoxygenases are known as responsible for the reaction of oxygenation of poly-unsaturated fatty acid producing hydroperoxid acids (toxic) that can be converted into a different secondary metabolites. For years, the presence of lipoxygenases has been described only in eukaryotes, mammals, plants, fungi and small invertebrates. The biological function of eukaryotic lipoxygenases has been widely studied. They are involved in the synthesis of leukotrienes as signaling molecules in mammals, or in the jasmonic acid in plants. In 1964, Shimahara, published the existence of lipoxygenases of gram-negative bacteria isolated from the trash. Even today there are few data concerning bacterial lipoxygenases published. Some examples are those of Thermoactinomyces vulgaris, Pseudomonas and Nostoc punctiforme. The analysis were performed using the BLAST program and the results indicate that there are "LOX-like" genes in Shewanella, Burkolderia, Nitrosomonas and Myxococcus, but the biological function of prokaryotic lipoxygenases is not yet clear. However, lipoxygenases published in the database "gene data-bank" are marine organisms and environmental grounds, suggesting that the lipoxygenases can play an important role in biodegradation. This study reports the first molecular structure of a prokaryotic lipoxygenasa and a preliminary study of the phylogeny of this group of proteins.

Keywords

Pseudomonas; Estructura molecular; Molecular structure; Lipoxigenasa; Lipoxygenase; Filogènia; Filogenia; Phylogeny; Microarrays

Subjects

579 - Microbiology

Knowledge Area

Ciències de la Salut

Documents

AGiG_TESI.pdf

17.56Mb

 

Rights

ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.

This item appears in the following Collection(s)