2024-03-28T13:37:27Zhttps://www.tdx.cat/oai/requestoai:www.tdx.cat:10803/71142024-03-15T10:57:34Zcom_10803_236col_10803_690278
Micro RNA-Mediated regulation of the full-length and truncated isoforms of human neurotrophic tyrosine kinase receptor type 3 (NTRK 3)
Guidi, Mònica
monicaguidi@yahoo.com
true
Espinosa Parrilla, Yolanda
Estivill, Xavier
RISC complex
retinoic acid
renilla luciferase
real-time quantitative PCR
PTBP1
pri-miRNA
pre-miRNA
post-transcriptional regulation
piRNA
PicTar
pGL4.13
PCR
P-body
p75NTR
overexpression
NTRK3
NTRK2
NTRK1
non-coding RNAs
NGF
neurotrophin
neurotrophic signaling
neuronal differentiation
neurodevelopment
neuroblastoma
nervous system
mRNA
miRNA target prediction
miRNA profiling
miRNA mimic
miRNA microarray
miRNA inhibitor
miRanda
microRNA
microarray
luciferase assay
Ingenuity Pathway Analysis (IPA)
heLa cells
gene silencing
gene regulation
full-length isoform (FL-NTRK3)
firefly luciferase
ERK
disease
dicer
cancer development
BDNF
argonaute
alternative splicing
3'UTR
RNAhybrid
RT-PCR
SH-SY5Y cells
siRNA
standard error
synaptic plasticity
target validation
TargetScan
transfection
translational repression
TrkA
TrkB
TrkC
truncated isoform (TR-NTRK3)
tyrosine kinase (TK)
western blot
Neurotrophins and their receptors are key molecules in the development of the<br/>nervous system. Neurotrophin-3 binds preferentially to its high-affinity receptor<br/>NTRK3, which exists in two major isoforms in humans, the full-length kinaseactive<br/>form (150 kDa) and a truncated non-catalytic form (50 kDa). The two<br/>variants show different 3'UTR regions, indicating that they might be differentially<br/>regulated at the post-transcriptional level. In this work we explore how<br/>microRNAs take part in the regulation of full-length and truncated NTRK3,<br/>demonstrating that the two isoforms are targeted by different sets of microRNAs.<br/>We analyze the physiological consequences of the overexpression of some of the<br/>regulating microRNAs in human neuroblastoma cells. Finally, we provide<br/>preliminary evidence for a possible involvement of miR-124 - a microRNA with no<br/>putative target site in either NTRK3 isoform - in the control of the alternative<br/>spicing of NTRK3 through the downregulation of the splicing repressor PTBP1.
Las neurotrofinas y sus receptores constituyen una familia de factores cruciales<br/>para el desarrollo del sistema nervioso. La neurotrofina 3 ejerce su función<br/>principalmente a través de una unión de gran afinidad al receptor NTRK3, del cual<br/>se conocen dos isoformas principales, una larga de 150KDa con actividad de tipo<br/>tirosina kinasa y una truncada de 50KDa sin dicha actividad. Estas dos isoformas<br/>no comparten la misma región 3'UTR, lo que sugiere la existencia de una<br/>regulación postranscripcional diferente. En el presente trabajo se ha explorado<br/>como los microRNAs intervienen en la regulación de NTRK3, demostrando que las<br/>dos isoformas son reguladas por diferentes miRNAs. Se han analizado las<br/>consecuencias fisiológicas de la sobrexpresión de dichos microRNAs utilizando<br/>células de neuroblastoma. Finalmente, se ha estudiado la posible implicación del<br/>microRNA miR-124 en el control del splicing alternativo de NTRK3 a través de la<br/>regulación de represor de splicing PTBP1.
2011-04-12T16:28:16Z
2009-02-09
2009-01-13
2009-02-09
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
9788469216972
http://www.tdx.cat/TDX-0209109-131109
http://hdl.handle.net/10803/7114
B.8847-2009
eng
ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
info:eu-repo/semantics/openAccess
Universitat Pompeu Fabra
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)