2024-03-29T02:08:17Zhttps://www.tdx.cat/oai/requestoai:www.tdx.cat:10803/24162017-09-25T09:48:49Zcom_10803_1col_10803_90
Diversitat fenotípica i genotípica del gènere "Aeromonas"
Miñana i Galbis, David
Loren Egea, José Gaspar
Fusté Munné, M. Carme
Aeromonas
Taxonomia bacteriana
Genètica de poblacions bacteriana
MLEE
Estructura clonal
Identificació
En aquest estudi es van aïllar un total de 199 soques mesòfiles del gènere <i>Aeromonas</i> a partir de mostres de mol·luscs bivalves i d'aigües dolces. El medi agar dextrina ampicil·lina (ADA) fou el medi de cultiu més eficient en l'aïllament d'<i>Aeromonas</i>. La selecció de 16 proves fenotípiques clau va permetre la identificació a nivell d'espècie del 91 % de les soques estudiades. Es va realitzar un estudi de taxonomia numèrica amb 64 proves fenotípiques i 220 soques que, al 89 % de <i>S[sub SM]</i>, va definir huit <i>phena</i> (I-VIII). Totes les soques d'una mateixa espècie o de diverses espècies d'un mateix complex fenotípic o fenoespècie es van agrupar en un únic <i>phenon</i>, excepte les soques tipus d'<i>A. salmonicida</i> i d'<i>A. media</i> que no s'agruparen en cap dels <i>phena</i> definits. Els <i>phena</i> V, VI i VII agruparen soques aïllades de mol·luscs bivalves no identificades a nivell d'espècie, la qual cosa suggereix l'existència de noves espècies del gènere <i>Aeromonas</i>. Per una altra banda, mentre la majoria de les espècies mostraren activitat beta-hemolítica, únicamente les espècies <i>A. hydrophila, A. bestiarum</i> i <i>A. salmonicida</i> van presentar activitat elastolítica. La presència d'espècies d'<i>Aeromonas</i> patògenes oportunistes i d'altres espècies amb factors de virulència fa recomanable la monitorització d'<i>Aeromonas</i> en aigües (potables, recreatives i de piscifactories) i en aliments que, com les ostres, es consumeixen crus o poc cuits.<br/>Es va aplicar la tècnica d'electroforesi d'enzims multilocus (MLEE) a 122 soques de les espècies <i>A. hydrophila, A. bestiarum, A. salmonicida, A. popoffii</i> i <i>A. trota</i>. Mitjançant l'anàlisi de 15 enzims, s'obtingueren 79 perfils al·lèlics o tipus electroforètics (ETs). La diversitat genètica mitjana (<i>H</i>) de la mostra completa fou 0,64. Les subpoblacions <i>A. hydrophila</i> i <i>A. salmonicida</i> van presentar major diversitat genètica que les subpoblacions <i>A. popoffii</i> i <i>A. bestiarum</i>. Per una altra banda, l'anàlisi del desequilibri de lligament suggereix que l'estructura poblacional d'<i>Aeromonas</i> és clonal, ja què l'índex d'associació (<i>I-subA</i>) fou significativament diferent de 0 (<i>I-subA</i>=2,38, <i>P</i> menor que 0,0001). A una distància genètica menor que o igual a 0,7 el dendrograma de la relació genètica entre ETs va separar clarament les espècies <i>A. salmonicida</i> (grup II), <i>A. trota</i> (grup III) i <i>A. hydrophila</i> (grup IV), en canvi, les espècies <i>A. bestiarum</i> (subgrup Ib) i <i>A. popoffii</i> (subgrup Ic) es van separar a una distància genètica memor que o igual a 0,6. Les soques mesòfiles i psicròfiles de l'espècie <i>A. salmonicida</i> s'agruparen conjuntament. El dendrograma de la relació genètica entre ETs també va mostrar una bona correlació amb l'origen de les soques. <br/>Finalment, la comparació entre la identificació fenotípica de les soques i les freqüències al·lèliques obtingudes en la técnica MLEE va mostrar que cinc loci, EST1 (esterasa 1), HEX (hexoquinasa), IDH (isocitrat deshidrogenasa), LDH1 (lactat deshidrogenasa 1) i MDH (malat deshidrogenasa), identifiquen correctament el 94 % de les soques estudiades.
2003-07-23
2003-07-23
2003-07-23
2002-12-20
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
8468830313
http://www.tdx.cat/TDX-0723103-122424
http://hdl.handle.net/10803/2416
B.39372-2003
cat
ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
info:eu-repo/semantics/openAccess
Universitat de Barcelona
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)