2024-03-29T10:27:49Zhttps://www.tdx.cat/oai/requestoai:www.tdx.cat:10803/86692017-09-12T11:28:57Zcom_10803_311col_10803_322
nam a 5i 4500
errors d'anotació
sequència shine-Dalgarno
regions intergèniques
origen de replicació
gens solapats
Bacteriana
Genómica
Computational insights into intergenic regions and overlapping genes among prokaryote genomes
[Tarragona] :
Universitat Rovira i Virgili,
2011
Accés lliure
http://hdl.handle.net/10803/8669
cr |||||||||||
AAMMDDs2011 sp ||||fsm||||0|| 0 eng|c
9788469221501
Pallejà Caro, Albert,
autor
Tesi
Doctorat
Universitat Rovira i Virgili. Departament de Bioquímica i Biotecnologia
2009
Universitat Rovira i Virgili. Departament de Bioquímica i Biotecnologia
Tesis i dissertacions electròniques
Romeu Figuerola,Antoni,
supervisor acadèmic
TDX
Computational Insights into Intergenic Regions and Overlapping Genes among Prokaryote Genomes<br/>Tot i la gran varietat d'estils de vida de les espècies bacterianes, tots ells presenten trets arquitectònics comuns. En aquesta tesi s'estudia les regions intergèniques i els solapaments entre gens en els genomes procariotes.<br/>Hem vist que per predir els orígens de replicació, a part de l'anàlisi de la composició de nucleòtids del DNA, es requereix experiments computacionals complementaris per aconseguir millors prediccions. Els solapaments entre gens acostumen a ser curts, respecten el codi genètic i es veuen influenciats per la pressió selectiva en contra de grans solapaments. En canvi, com més llarg és un solapament entre dos gens, més risc hi ha que una mutació pugui afectar a dues proteïnes de la cèl·lula al mateix temps. Hem detectat que els solapaments més llargs de 60 parells de bases són deguts a errors en la seqüenciació o en l'anotació dels gens. En quant a les regions intergèniques, hem vist que la presència d'una seqüència reguladora entre gens, com és la Shine-Dalgarno (responsable de iniciar eficientment la traducció de RNA missatger a proteïna) pot influir en la mida d'aquestes regions i afectar l'ús de codons d'aturada. Finalment, hem construït una aplicació web ( http://genomes.urv.cat/pwneigh/ ) que permet estudiar fàcilment la conservació els solapaments en les espècies i les regions intergèniques en els genomes procariotes.
r
ES-BaCBU
cat
rda
ES-BaCBU
text
txt
rdacontent
informàtic
c
rdamedia
recurs en línia
cr
rdacarrier