2024-03-29T12:19:10Zhttps://www.tdx.cat/oai/requestoai:www.tdx.cat:10803/6875202023-07-10T22:47:15Zcom_10803_311col_10803_315
nam a 5i 4500
Mass Spectrometry Imagin
Annotation
Software
Computational tools for the annotation of in-source fragments and matrix-related signals in MALDI Mass Spectrometry Imaging
[Tarragona] :
Universitat Rovira i Virgili,
2023
Accés lliure
http://hdl.handle.net/10803/687520
cr |||||||||||
AAMMDDs2023 sp ||||fsm||||0|| 0 eng|c
Baquer Gómez, Gerard,
autor
1 recurs en línia (211 pàgines)
Tesi
Doctorat
Universitat Rovira i Virgili. Departament d'Enginyeria Electrònica, Elèctrica i Automàtica
2023
Universitat Rovira i Virgili. Departament d'Enginyeria Electrònica, Elèctrica i Automàtica
Tesis i dissertacions electròniques
Correig Blanchar, Francesc Xavier,
supervisor acadèmic
Ràfols Soler, Pere,
supervisor acadèmic
TDX
L´espectrometria de masses d´imatge MALDI (MALDI-MSI) és una tècnica analítica utilitzada en estudis bioquímics i
clínics per revelar la composició química i la informació espacial de teixits orgànics. Els fragments generats dins de la
font MALDI i els senyals relacionats amb la matriu abarroten els espectres, cosa que fa que la identificació de cada
massa a càrrega (m/z) sigui un desafiament. En aquesta tesi, desenvolupem dues eines computacionals
(rMSIfragment i rMSIcleanup) per a l'anotació controlada per FDR de fragments a la font i senyals relacionats amb la
matriu. També presentem un protocol computacional i experimental complet basat en una matriu MALDI marcada amb
isòtops estables per descobrir senyals relacionats amb la matriu. Demostrem l'alt rendiment de les nostres eines i
protocols en múltiples tipus de mostres, matrius MALDI i analitzadors MS. També trobem que l'eliminació d'aquests
senyals permet que les tècniques de reducció de dimensionalitat se centrin millor en les característiques espacials
biològicament rellevants i millorin l'anotació de metabòlits. En conjunt, aquests resultats indiquen que l'anotació de
fragments a la font i els senyals relacionats amb la matriu s'han d'incloure en estudis rigorosos de metabolòmica no
dirigits utilitzant MSI.
r
ES-BaCBU
cat
rda
ES-BaCBU
text
txt
rdacontent
informàtic
c
rdamedia
recurs en línia
cr
rdacarrier