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Tilling
Melón
Biotecnologia vegetal
Desarrollo de una plataforma de tilling en melón (Cucumis melo L.)
[Barcelona] :
Universitat Autònoma de Barcelona,
2014
Accés lliure
http://hdl.handle.net/10803/133281
cr |||||||||||
AAMMDDs2014 sp ||||fsm||||0|| 0 spa|c
9788449043628
González To, Mireia,
autor
1 recurs en línia (282 pàgines)
Tesi
Doctorat
Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular
2014
Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular
Tesis i dissertacions electròniques
Garcia Mas, Jordi,
supervisor acadèmic
Espunya i Prat, Ma. Carme,
supervisor acadèmic
TDX
El trabajo descrito en esta tesis doctoral se enmarca dentro del proyecto MELOGEN (GEN2013‑
20237, 2004‑2007) uno de cuyos objetivos era la construcción de una plataforma de TILLING en
melón.
La disponibilidad de recursos genéticos y genómicos para el melón se ha incrementado a lo largo
de los últimos años e incluso la secuencia del genoma está disponible. Sin embargo, las
herramientas genómicas para determinar la funcionalidad de los genes en esta especie son
todavía limitadas. El TILLING (Targeting Induced Local Lesions IN Genomes) es un método de
genética inversa mediante el cual se pueden crear e identificar nuevas mutaciones en genes
candidatos y observar su efecto fenotípico. Además, también se pueden detectar fenotipos de
interés para posteriormente identificar la mutación responsable de los mismos.
En este trabajo se ha desarrollado una población de TILLING en Cucumis melo a partir de la línea
doble haploide del tipo “Piel de Sapo” M62‑113. Aplicando inicialmente el mutágeno químico
EMS (Etil Metano Sulfonato) sobre 17.000 semillas se ha desarrollado una colección de mutantes
compuesta por 3.268 familias M2. A partir de 400 familias M2 se observaron diversos fenotipos
mutantes en las diferentes etapas de crecimiento de la planta. Algunos de estos mutantes se han
descrito con detalle generando un catálogo de los fenotipos observados en cada familia, algunos
de los cuales pueden tener interés comercial.
Para medir la tasa de mutación de la población se han analizado cuatro genes, la fitoeno
desaturasa PDS, los factores de iniciación de la traducción eIF4E y eIF(iso)4E y el receptor de
etileno ETR1. Los mutantes detectados han permitido calcular la tasa de mutación de la
población, una mutación cada 1,5 Mb. En el caso de PDS se ha podido obtener un mutante con
fenotipo albino, demostrando así la efectividad del método TILLING en melón. Además,
paralelamente se analizaron los mismos genes en otra población mutagenizada independiente.
También se realizó un estudio de EcoTILLING con 113 accesiones de melón y se identificaron 19
haplotipos distintos en el gen eIF4E, uno de ellos, con un SNP que provoca un cambio de
aminoácido y que sólo se encuentra en la accesión PI 505602 y dos haplotipos en el gen ETR1, uno
de los cuales también contiene un SNP que provoca un cambio de aminoácido.
El TILLING facilitará los estudios de genética inversa en melón y abre la puerta a futuros
estudios de genómica funcional en un genoma recientemente secuenciado. Este trabajo ha
representado también el primer paso para poder desarrollar nuevas poblaciones de TILLING en
melón con mayores tasas de mutación y en otros fondos genéticos.
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