2024-03-28T16:05:56Zhttps://www.tdx.cat/oai/requestoai:www.tdx.cat:10803/1290802017-09-18T12:38:32Zcom_10803_120col_10803_171
nam a 5i 4500
Fatty acid metabolism
Adipose tissue
Pork
Functional genomics and candidate genes for meat quality traits in pigs
[Barcelona] :
Universitat Autònoma de Barcelona,
2014
Accés lliure
http://hdl.handle.net/10803/129080
cr |||||||||||
AAMMDDs2014 sp ||||fsm||||0|| 0 eng|c
9788449040870
Corominas Galbany, Jordi,
autor
1 recurs en línia (243 pàgines)
Tesi
Doctorat
Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments
2013
Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments
Tesis i dissertacions electròniques
Folch Albareda, Josep Maria,
supervisor acadèmic
Ballester Devis, Maria,
supervisor acadèmic
TDX
El cerdo es la especie doméstica más importante económicamente, no solo por ser la principal fuente de carne en la dieta humana, sino también por su papel como modelo animal para la investigación biomédica. La buena compresión de los mecanismos moleculares que afectan a la calidad de la carne en cerdos es esencial para la obtención de carnes con un patrón saludable de ácidos grasos sin afectar el rendimiento productivo. La composición de ácidos grasos es un carácter muy importante para la calidad de la carne; no obstante, nuestro conocimiento sobre la compleja red de procesos y vías metabólicas que forman el metabolismo de los ácidos grasos sigue siendo limitado. Esta tesis tiene como objetivo general mejorar el entendimiento de estos procesos moleculares, con el fin de comprender mejor la arquitectura genética de la calidad de la carne en el cerdo.
Se ha evaluado la implicación funcional de la variante DQ144454:c.2645G<A en la expresión del ACSL4, observando en hígado una mayor expresión en los animales con el alelo G en comparación con los que presentan el alelo A. Se realizó un estudio de asociación (eGWAS) con la expresión génica de ACSL4 identificando dos regiones en los cromosomas 6 y 12 con genes que pueden estar relacionados con la expresión del gen.
El gen ELOVL6 ha sido analizado como gen candidato para el QTL del cromosoma 8, relacionado con el contenido de ácidos palmítico y palmitoleico. Se ha determinado la arquitectura genética del gen ELOVL6, mostrando dos isoformas expresadas en hígado y tejido adiposo. El SNP ELOVL6:c.-533C>T presentó una alta asociación con la expresión del propio gen y el contenido de los ácidos palmítico y palmitoleico en músculo y tejido adiposo. Estudios funcionales del promotor del gen validaron la unión de SREBF1 y ERα, sugiriendo un papel importante de ambos factores de transcripción en la regulación del gen ELOVL6. Curiosamente, el SNP ELOVL6:c.-394G>A se encuentra en desequilibrio de ligamiento con el SNP ELOVL6:c.-533C>T y también se encuentra localizado en el único lugar de unión de ERα en el promotor. Además, los estudios realizados permitieron observar una unión diferencial de ERα en función del genotipo del ELOVL6:c.-394G>A, mostrando su unión solo en los animales portadores del alelo G. La unión de ERα ha sido asociada al reclutamiento de metilasas y, consecuentemente, al aumento de los niveles de metilación de los motivos CpG adyacentes. Por lo tanto, las diferencias en la unión de ERα y en el grado de metilación del promotor pueden ser los factores causales de la menor expresión del gen en animales con el alelo G. Por este motivo proponemos el SNP ELOVL6:c.-394G>A como el principal SNP causal de las variaciones fenotípicas del QTL.
Finalmente, el transcriptoma del tejido adiposo de cerdos fenotípicamente extremos para la composición de ácidos grasos en músculo fue secuenciado mediante RNA-Seq. Se realizó un análisis de expresión diferencial que permitió identificar 396 genes diferencialmente expresados que modulaban principalmente la lipogénesis, probablemente debido a las diferencias en el contenido de ácidos grasos poliinsaturados entre grupos. Este efecto de la composición de ácidos grasos sobre la expresión de genes lipídicos sugiere que los genes diferencialmente expresados pueden desempeñar un papel importante en el metabolismo de los lípidos y de los ácidos grasos.
a
ES-BaCBU
cat
rda
ES-BaCBU
text
txt
rdacontent
informàtic
c
rdamedia
recurs en línia
cr
rdacarrier