La malaltia de Crohn és una malaltia inflamatòria intestinal crònica d'etiologia encara desconeguda. Actualment es pensa que hi participen factors genètics i immunològics que confereixen una susceptibilitat a l'hoste, i factors externs o ambientals, com serien els microorganismes i/o l'estil de vida. L'objectiu principal d'aquest treball ha estat descriure les poblacions bacterianes associades especialment als malalts de Crohn, amb la intenció d'identificar possibles agents etiològics. Els resultats d'aquest treball coincideixen amb investigacions prèvies que descriuen l'alteració bacteriana present en els malalts de Crohn (disbiosi) i recolzen la hipòtesi que implica el recentment descrit patovar "Adherent- Invasive Escherichia coli" (AIEC) en l'etiologia d'aquesta malaltia inflamatòria intestinal. A més, contribuïm a la descripció de les poblacions d'E. coli associades a la mucosa intestinal aportant dades sobre aspectes ecològics i patogènics. Finalment, descrivim nous aspectes fenotípics d'AIEC que podrien estar relacionats amb la seva patogènia, com seria la capacitat de formar biofilms.

Crohn's disease is a chronic inflammatory bowel disorder of unknown aetiology. Genetic and immunologic features that confer susceptibility on the host, together with external or environmental factors such as microorganisms and lifestyle, are thought to be involved. The main purpose of this work was to describe the bacterial populations particularly related with Crohn's disease patients in order to identify putative etiologic agents. The results are in agreement with previous research on the entire microbial community associated with Crohn's disease, providing evidence of a situation of dysbiosis, and further support the hypothesis of a putative implication of the recently described pathovar Adherent-Invasive Escherichia coli (AIEC). In addition, this work contributes to the understanding of mucosa-associated E. coli populations by providing new data about their ecological parameters and pathogenic features. Finally, we have also contributed to a better description of the AIEC pathovar by contrasting it with close pathogenic E. coli strains and finding new pathogenic features such as biofilm formation.