Evolutionary genetics of malaria: genetic susceptibility and natural selection

dc.contributor
Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.contributor.author
Sikora, Martin
dc.date.accessioned
2011-04-12T16:30:03Z
dc.date.available
2011-02-03
dc.date.issued
2010-06-04
dc.date.submitted
2011-02-03
dc.identifier.isbn
978-84-694-2109-3
dc.identifier.uri
http://www.tdx.cat/TDX-0203111-142820
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/10803/7220
dc.description.abstract
Una de les forces selectives més fortes que han afectat a les poblacions humanes en la història més recent és el paràsit de la malària: Plasmodium falciparum, que és la causa de varis exemples d'adaptació induïda per patògens en els éssers humans. Una forma especial de malària és l'associada a l'embaràs, que es caracteritza per l'acumulació d'eritròcits infectats en la placenta, i que pot arribar a causar fins a 200.000 morts maternoinfantils cada any. L'objectiu d'aquest treball és descriure com aquesta forma peculiar de malària ha afectat la variació genètica humana. Amb aquesta finalitat, hem utilitzat mètodes tant de la genètica evolutiva com de l'epidemiologia molecular, resultant en la primera investigació a gran escala de la base genètica de la malària placentària. Els resultats ofereixen una nova visió sobre els gens que modulen el risc d'infecció, ,així com de la selecció natural actuant sobre les vies cel·lulars implicades en la patogènesi de la malaltia. Finalment, també aportem noves dades sobre l'estructura genètica de les poblacions sub-saharianes analitzades.
cat
dc.description.abstract
One of the strongest selective forces affecting human populations in recent history is the malaria parasite Plasmodium falciparum, which is the cause of a variety of well-established examples of pathogen-induced adaptation in humans. A special form of malaria is pregnancy-associated malaria, which is characterised by the accumulation of infected erythrocytes in the placenta, and causes up to 200,000 maternal and infant deaths every year. The aim of this work is to characterise how this particular form of malaria has shaped human genetic variation. To that end we use methods of both evolutionary genetics and molecular epidemiology, reporting the first large-scale investigation of the genetic basis of placental infection. Our results provide new insights into genes modulating the risk of infection, as well as natural selection acting on cellular pathways involved in the pathogenesis of the disease. Finally, we also provide new data on the genetic structure of affected populations in Sub-Saharan Africa.
eng
dc.format.mimetype
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Universitat Pompeu Fabra
dc.rights.license
ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.source
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.subject
variació genètica humana
dc.subject
evolució molecular
dc.subject
glicosilació
dc.subject
estudi d'associació genètica
dc.subject
SNPs
dc.subject
estructura de poblacions
dc.subject
anàlisi de xarxes
dc.subject
genètica las poblacions
dc.subject
xarxes funcionals
dc.subject
anàlisi de vies
dc.subject
inflamació
dc.subject
immunitat
dc.subject
selecció positiva
dc.subject
interaccions hoste-patogen
dc.subject
citoadherència
dc.subject
susceptibilitat genètica
dc.subject
malària placentària
dc.subject
malària
dc.subject
Human genetic variation
dc.subject
Molecular evolution
dc.subject
Glycosylation
dc.subject
Population structure
dc.subject
Genetic association study
dc.subject
SNPs
dc.subject
Population history
dc.subject
Population genetics
dc.subject
Network analysis
dc.subject
Functional networks
dc.subject
Pathway analysis
dc.subject
Inflammation
dc.subject
Immunity
dc.subject
Positive selection
dc.subject
Host-pathogen interactions
dc.subject
Placental malaria
dc.subject
Genetic susceptibility
dc.subject
Cytoadherence
dc.subject
Malaria
dc.title
Evolutionary genetics of malaria: genetic susceptibility and natural selection
dc.type
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.subject.udc
575
cat
dc.subject.udc
616.9
cat
dc.contributor.authoremail
martin.sikora@upf.edu
dc.contributor.director
Casals López, Ferran
dc.contributor.director
Bertranpetit, Jaume
dc.rights.accessLevel
info:eu-repo/semantics/openAccess
cat
dc.identifier.dl
B.7281-2011
dc.description.degree
Programa de doctorat en Biomedicina


Documents

tms.pdf

19.04Mb PDF

This item appears in the following Collection(s)