Micro RNA-Mediated regulation of the full-length and truncated isoforms of human neurotrophic tyrosine kinase receptor type 3 (NTRK 3)

dc.contributor
Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.contributor.author
Guidi, Mònica
dc.date.accessioned
2011-04-12T16:28:16Z
dc.date.available
2009-02-09
dc.date.issued
2009-01-13
dc.date.submitted
2009-02-09
dc.identifier.isbn
9788469216972
dc.identifier.uri
http://www.tdx.cat/TDX-0209109-131109
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/10803/7114
dc.description.abstract
Neurotrophins and their receptors are key molecules in the development of the<br/>nervous system. Neurotrophin-3 binds preferentially to its high-affinity receptor<br/>NTRK3, which exists in two major isoforms in humans, the full-length kinaseactive<br/>form (150 kDa) and a truncated non-catalytic form (50 kDa). The two<br/>variants show different 3'UTR regions, indicating that they might be differentially<br/>regulated at the post-transcriptional level. In this work we explore how<br/>microRNAs take part in the regulation of full-length and truncated NTRK3,<br/>demonstrating that the two isoforms are targeted by different sets of microRNAs.<br/>We analyze the physiological consequences of the overexpression of some of the<br/>regulating microRNAs in human neuroblastoma cells. Finally, we provide<br/>preliminary evidence for a possible involvement of miR-124 - a microRNA with no<br/>putative target site in either NTRK3 isoform - in the control of the alternative<br/>spicing of NTRK3 through the downregulation of the splicing repressor PTBP1.
dc.description.abstract
Las neurotrofinas y sus receptores constituyen una familia de factores cruciales<br/>para el desarrollo del sistema nervioso. La neurotrofina 3 ejerce su función<br/>principalmente a través de una unión de gran afinidad al receptor NTRK3, del cual<br/>se conocen dos isoformas principales, una larga de 150KDa con actividad de tipo<br/>tirosina kinasa y una truncada de 50KDa sin dicha actividad. Estas dos isoformas<br/>no comparten la misma región 3'UTR, lo que sugiere la existencia de una<br/>regulación postranscripcional diferente. En el presente trabajo se ha explorado<br/>como los microRNAs intervienen en la regulación de NTRK3, demostrando que las<br/>dos isoformas son reguladas por diferentes miRNAs. Se han analizado las<br/>consecuencias fisiológicas de la sobrexpresión de dichos microRNAs utilizando<br/>células de neuroblastoma. Finalmente, se ha estudiado la posible implicación del<br/>microRNA miR-124 en el control del splicing alternativo de NTRK3 a través de la<br/>regulación de represor de splicing PTBP1.
dc.format.mimetype
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Universitat Pompeu Fabra
dc.rights.license
ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.source
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.subject
RISC complex
dc.subject
retinoic acid
dc.subject
renilla luciferase
dc.subject
real-time quantitative PCR
dc.subject
PTBP1
dc.subject
pri-miRNA
dc.subject
pre-miRNA
dc.subject
post-transcriptional regulation
dc.subject
piRNA
dc.subject
PicTar
dc.subject
pGL4.13
dc.subject
PCR
dc.subject
P-body
dc.subject
p75NTR
dc.subject
overexpression
dc.subject
NTRK3
dc.subject
NTRK2
dc.subject
NTRK1
dc.subject
non-coding RNAs
dc.subject
NGF
dc.subject
neurotrophin
dc.subject
neurotrophic signaling
dc.subject
neuronal differentiation
dc.subject
neurodevelopment
dc.subject
neuroblastoma
dc.subject
nervous system
dc.subject
mRNA
dc.subject
miRNA target prediction
dc.subject
miRNA profiling
dc.subject
miRNA mimic
dc.subject
miRNA microarray
dc.subject
miRNA inhibitor
dc.subject
miRanda
dc.subject
microRNA
dc.subject
microarray
dc.subject
luciferase assay
dc.subject
Ingenuity Pathway Analysis (IPA)
dc.subject
heLa cells
dc.subject
gene silencing
dc.subject
gene regulation
dc.subject
full-length isoform (FL-NTRK3)
dc.subject
firefly luciferase
dc.subject
ERK
dc.subject
disease
dc.subject
dicer
dc.subject
cancer development
dc.subject
BDNF
dc.subject
argonaute
dc.subject
alternative splicing
dc.subject
3'UTR
dc.subject
RNAhybrid
dc.subject
RT-PCR
dc.subject
SH-SY5Y cells
dc.subject
siRNA
dc.subject
standard error
dc.subject
synaptic plasticity
dc.subject
target validation
dc.subject
TargetScan
dc.subject
transfection
dc.subject
translational repression
dc.subject
TrkA
dc.subject
TrkB
dc.subject
TrkC
dc.subject
truncated isoform (TR-NTRK3)
dc.subject
tyrosine kinase (TK)
dc.subject
western blot
dc.title
Micro RNA-Mediated regulation of the full-length and truncated isoforms of human neurotrophic tyrosine kinase receptor type 3 (NTRK 3)
dc.type
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.subject.udc
577
dc.contributor.authoremail
monicaguidi@yahoo.com
dc.contributor.director
Espinosa Parrilla, Yolanda
dc.contributor.director
Estivill, Xavier
dc.rights.accessLevel
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.identifier.dl
B.8847-2009
dc.description.degree
Programa de doctorat en Biomedicina


Documents

tmg.pdf.pdf

24.39Mb PDF

This item appears in the following Collection(s)