Universitat Pompeu Fabra
Espinosa Parrilla, Yolanda
2016-10-28
167 p.
Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
Els microRNAs són importants reguladors de gens i destacats contribuïdors a la diversitat fenotípica clarament involucrats en malaltia humana. Hem analitzat la variabilitat genètica en microRNAs i como aquesta variabilitat pot afectar a la biologia i funció dels microRNAs. Hem comparat la variació genètica a les diferents regions dels microRNAs i hem trobat que les regions madura i “llavor” acumulen menys variants comunes que la resta del microRNA, probablement com a resultat de l’acció de selecció purificadora. Seguidament vam estudiar les conseqüències funcionals de variants associades amb càncer, incloent una variant que el nostre grup va trobar associada a càncer gàstric, i vam observar com aquestes eren capaces d’alterar l’expressió dels propis microRNAs així com els gens i xarxes gèniques regulades per aquests microRNAs. Vam mostrar l’existència de regulació específica d’al·lel de tres gens involucrats en càncer per part dels microRNAs que contenen les variants associades genèticament amb càncer.
MicroRNAs are important gene regulators and major contributors to phenotypic diversity that are clearly involved in human disease. In this thesis we analysed genetic variation in human microRNAs and how microRNA variants could modify their biological effect and role in Cancer. We compared genetic variation in distinct microRNA regions and found that mature and seed regions accumulate less high frequency variants than the rest of the microRNA gene, probably as a result of purifying selection. Also, we analyzed the genetic variation of different microRNA regions in human populations and identified consistently high population fixation indexes in the seed compared with other regions suggesting the existence of local adaptation in this important microRNA region Then we studied the functional consequences of Cancer genetically associated variants, including one that we found associated with gastric Cancer in European populations, and found that these variants could alter microRNA expression and the repertoire of target gene and networks. Finally we could show allele dependent regulation of three Cancer related genes by the microRNAs carrying these variants.
Càncer d’estomac; Estudis funcionals; Genètica; Al.lel; MicroRNA; MiRNA; Genetics; Stomach cancer; Allele
575 - General genetics. General cytogenetics
ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
