Universitat Pompeu Fabra
Valcárcel, J. (Juan)
2016-11-23
196 p.
Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
Alternative pre-mRNA splicing of the Notch regulator NUMB exon 9 switches between isoforms that promote (exon inclusion) or prevent (exon skipping) cell proliferation. We have studied NUMB alternative splicing regulation by RBM10, an RNA binding protein frequently utated in lung adenocarcinomas. The study of cancer-associated BM10 variants revealed domains and residues important for RBM10 function. Structure-function analysis identified residues in RRM2 that, without compromising RNA binding, fail to regulate NUMB exon 9. Immunoprecipitation and mass spectrometry analyses revealed interactors that include U2 snRNP and PRP19 spliceosomal components, allowing us to propose a mechanism for 3' splice site repression by RBM10.
L’empalmament alternatiu del pre-mARN de NUMB, un regulador de Notch, varia entre dos isoformes que promouen (inclusió de l’exó 9) o prevenen (salt de l’exó 9) la proliferació cel•lular. Hem estudiat la regulació de l’empalmament alternatiu de NUMB controlada per RBM10, una proteïna d’unió al ARN freqüentment mutada en càncer de pulmó. L’estudi de variants d’RBM10 associades a càncer revela dominis i residus importants per a la funció de RBM10. Mitjançant anàlisis estructurals i funcionals hem identificat residus al RRM2 que, quan mutats, no comprometen la unió al ARN però són incapaços d’alterar la regulació de l’exó 9 de NUMB. Anàlisis de co-immunoprecipitació i espectrometria de masses assenyalen interactors que inclouen U2 snRNP i PRP19 que ens permeten proposar un mecanisme de repressió del lloc d’empalmament al 3’ reprimit per RBM10.
RBM10; NUMB; Lung Cancer; Càncer de pulmó; Alternative splicing; Empalmament alternatiu
577 - Material bases of life. Biochemistry. Molecular biology. Biophysics
ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
