La recerca en la que es realitzen els estudis de doctorat del Departament de Física Aplicada s’emmarca dins de l’àmbit de la Física, de la Matemàtica i de l’Enginyeria i es distribueix en cinc àrees: Física de la Terra i el Cosmos; Física dels Materials; Fluids i Dinàmica No Lineal; Fotònica; i Simulació en Matèria Condensada i Sistemes Complexos.