Role of KCN E4 on the voltage gated potassium channel Kv1.3 = Paper de KCNE4 en el canal de potassi dependent de voltage Kv1.3

Author

Solé i Codina, Laura

Director

Felipe Campo, Antonio

Date of defense

2013-12-13

Legal Deposit

B. 3984-2014

Pages

214 p.



Department/Institute

Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular (Biologia)

Abstract

Voltage gated potassium channels (Kv) play important roles in different biological process such as generation and propagation of the nerve pulse and the cardiac action potential, promotion of insulin secretion, cell volume control, induction of cell proliferation, apoptosis, migration and initiation of many signaling pathways. Kv channels can homo- or hetero- tetramerize. The composition of the channel modulates their surface expression and serves as a mechanism for regulating channel activity. Kv channel interaction with accessory subunits provides mechanisms for channels to respond to stimuli beyond changes in membrane potential. The present dissertation is focused in the analysis of the effect of one regulatory subunits family (KCNEs) on different Kv channels. The first channel analyzed is Kv7.1, which is one of the most well-known channels to interact with all the KCNE family members. In fact KCNE1-Kv7.1 complex is focus of a huge number of studies, due to its important role in heart. Most of the studies though are focused to their electrophysiological properties and molecular determinants involved in the interaction. We performed traffic analysis experiments of Kv7.1 in the present of KCNE1-5 and demonstrated that Kv7.1 membrane surface localization is modified by some of them. Next, analysis was expanded to another channel from the same family, less characterized: Kv7.5. We demonstrated that from the five KCNEs members, only KCNE1 and KCNE3 modulate Kv7.5 activity. Furthermore, we demonstrated that Kv7.5 association to KCNE3 modifies the targeting of the regulatory subunit. Next, we moved to a non-related Kv channel such as Kv1.3, which plays a crucial role in the immune system. We first focused into characterizing the modulation of Kv1.3. We demonstrated that KCNE4, but not KCNE2, functions as an inhibitory Kv1.3 partner. Kv1.3 trafficking, targeting and activity are altered by the presence of KCNE4. Furthermore, by the combination of a plethora of approaches such as electrophysiological experiments from chimeric proteins and GFP single bleaching counting steps methodology we deciphered the stoichiometry of the Kv1.3-KCNE4 complex. Next, by immunoprecipitation experiments, traffic analysis and electrophysiological experiments, we analyzed the molecular determinants involved in the association between Kv1.3 and KCNE4. We have map a domain of Kv1.3 and a specific motif of KCNE4 involved in the formation of Kv1.3-KCNE4 complex, but not in the modulation of the channel. We also proposed a 3D docking model of Kv1.3 and KCNE4. Finally, due to the importance of Kv1.3 in the immune system, the expression of all the KCNE family has been analyzed in several cell lines of leukocytes. We have demonstrated that all KCNEs suffer a differential regulation among proliferation of leukocytes. Furthermore, a different regulation can be observed, depend on the mode of leukocytes’ activation. Our results further suggest a new and yet unidentified physiological role for KCNE subunits in the immune system. Putative associations of these ancillary proteins with Kv channels would yield a wide variety of biophysically and pharmacologically distinct channels that fine-tune the immunological response.


Els canals de potassi dependents de voltatge (Kv) juguen un paper molt important tant en cèl•lules excitables com no excitables. La possibilitat de formar hetero-oligomers i la d’associació amb subunitats reguladores són uns dels mecanismes que existeixen per tal de proveir de diferents mecanismes per a respondre de manera diferent enfront a canvis en el potencial de membrana. La composició del canalosoma modula tant la seva expressió a superfície com l’activitat d’aquests. Aquesta tesi es centra en l’estudi de l’efecte del la família de les subunitats reguladores KCNE sobre diferents Kv. Primerament s’estudià l’efecte que causaven en el tràfic del canal Kv7.1 (canal model per a l’estudi dels KCNEs) i posteriorment s’amplià l’estudi a un altre membre de la mateixa família, Kv7.5. A continuació s’estudià un canal d’elevada importància per a l’activació i proliferació leucocitària: Kv1.3, centrant-nos sobretot en l’efecte causat per un dels KCNEs: KCNE4. Aquesta subunitat no només inhibeix dràsticament el corrent del canal Kv1.3, sinó que a més a més, modifica el seu tràfic i localització. Aquests canvis són deguts a una interacció directa entre ambdues proteïnes. A continuació s’estudià en detall el complex Kv1.3-KCNE4. Mitjançant la combinació d’experiments d’electrofisiologia i monitorització de fluorescència de molècules individuals en la membrana, es va poder establir l’estequiometria d’aquest complex. Posteriorment, mitjançant l’anàlisi de diverses proteïnes quimèriques i mutants, tant del canal com de la subunitat reguladora, es van cercar els determinants moleculars implicats en l’associació entre ambdues proteïnes. S’han pogut determinar els motius claus en KCNE4 i Kv1.3 implicats en la formació del complex, però no en la modulació del canal. Finalment, degut a la importància de Kv1.3 en el sistema immunitari, s’han analitzat els nivells d’expressió dels KCNEs en diferents línies leucocitàries. S’ha observat que aquestes subunitats pateixen una regulació diferencial en funció de la manera d’activació i al llarg de la proliferació del leucòcits, suggerint un possible paper en la regulació precisa de la resposta immunològica.

Keywords

Canals de potassi; Canales de potasio; Potassium channels; Proteïnes; Proteínas; Proteins; Subunitat proteica; Subunidad proteica; Protein subunit; Oligómero; Oligomer; Oligòmer

Subjects

577 - Material bases of life. Biochemistry. Molecular biology. Biophysics

Knowledge Area

Ciències Experimentals i Matemàtiques

Note

Retirats apartats 3.24 a 3.29, 4, 5, I 7 seguint instruccions de l’autora de la tesi / Retirados apartados 3.24 a 3.29, 4, 5, y 7 siguiendo instrucciones de la autora / The text of some sections (from 3.24 to 3.29, 4, 5, and 7) has been withdrawn on the instructions of the author

Documents

LSC_PhD_THESIS.pdf

22.41Mb

 

Rights

ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.

This item appears in the following Collection(s)