Computer-aided lesion detection and segmentation on breast ultrasound

Author

Pons Rodríguez, Gerard

Director

Martí Bonmatí, Joan

Martí Marly, Robert

Date of defense

2014-01-21

Legal Deposit

Gi. 245-2014

Pages

187 p.



Department/Institute

Universitat de Girona. Departament d'Arquitectura i Tecnologia de Computadors

Abstract

This thesis deals with the detection, segmentation and classification of lesions on sonography. The contribution of the thesis is the development of a new Computer-Aided Diagnosis (CAD) framework capable of detecting, segmenting, and classifying breast abnormalities on sonography automatically. Firstly, an adaption of a generic object detection method, Deformable Part Models (DPM), to detect lesions in sonography is proposed. The method uses a machine learning technique to learn a model based on Histogram of Oriented Gradients (HOG). This method is also used to detect cancer lesions directly, simplifying the traditional cancer detection pipeline. Secondly, different initialization proposals by means of reducing the human interaction in a lesion segmentation algorithm based on Markov Random Field (MRF)-Maximum A Posteriori (MAP) framework is presented. Furthermore, an analysis of the influence of lesion type in the segmentation results is performed. Finally, the inclusion of elastography information in this segmentation framework is proposed, by means of modifying the algorithm to incorporate a bivariant formulation. The proposed methods in the different stages of the CAD framework are assessed using different datasets, and comparing the results with the most relevant methods in the state-of-the-art


Aquesta tesi es centra en la detecció, segmentació i classificació de lesions en imatges d'ecografia. La contribució d'aquesta tesi és el desenvolupament d'una nova eina de Diagnòstic Assistit per Ordinador (DAO) capaç de detectar, segmentar i classificar automàticament lesions en imatges d'ecografia de mama. Inicialment, s'ha proposat l'adaptació del mètode genèric de detecció d'objectes Deformable Part Models (DPM) per detectar lesions en imatges d'ecografia. Aquest mètode utilitza tècniques d'aprenentatge automàtic per generar un model basat en l'Histograma de Gradients Orientats. Aquest mètode també és utilitzat per detectar lesions malignes directament, simplificant així l'estratègia tradicional. A continuació, s'han realitzat diferents propostes d'inicialització en un mètode de segmentació basat en Markov Random Field (MRF)-Maximum A Posteriori (MAP) per tal de reduir la interacció amb l'usuari. Per avaluar aquesta proposta, s'ha realitzat un estudi sobre la influència del tipus de lesió en els resultats aconseguits. Finalment, s'ha proposat la inclusió d'elastografia en aquesta estratègia de segmentació. Els mètodes proposats per a cada etapa de l'eina DAO han estat avaluats fent servir bases de dades diferents, comparant els resultats obtinguts amb els resultats dels mètodes més importants de l'estat de l'art

Keywords

Breast cancer; Càncer de mama; Cáncer de mama; Detection; Detecció; Detección; Segmentation; Segmentació; Segmentación; Ultrasound; Ultrasò; Ultrasonido; Computer-aided diagnosis; Diagnòstic assistit per ordinador; Diagnóstico asistido por ordenador; CAD; DAO

Subjects

616 - Pathology. Clinical medicine; 68 - Industries, crafts and trades for finished or assembled articles

Documents

tgpr.pdf

6.886Mb

 

Rights

ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.

This item appears in the following Collection(s)